Medrese, Gülfem Hatun Camii ile Hakimiyet-i Milliye Caddesi arasında idi. Mimar Sinan tarafından yapılmıştır. Tezkiretü'l-Mimarîn ve Tezkiretü'l-Ebniye'de Mimar Sinan'ın eserleri arasında zikredilmiştir. Gülfem Hatun Camii bahsine bakınız. Gülfem Hatun, 969 (1561-62) tarihinde, mabedini tamamlayamadan vefat ettiğine göre, medresenin bu tarihten bir müddet sonra yapıldığı söylenebilir. Klâsik medrese uslubunda yapılan bu eserin hangi tarihte yıkıldığı belli değildir. Hadîka yazarı; "Camiine yakın caddeye nazır türbesi ve yanında mektebi dahi vardır." Demekte ve medreseden hiç söz etmemektedir. Hafız Hüseyin Efendi, eserini 1182 (1768) tarihlerinde yazdığına göre, medrese bu sıralarda mevcut değildi. Muhtemelen 12 Zilhicce 1179 (22 Mayıs 1766)'daki büyük zelzelede yıkılmıştır.